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1. Extrahieren und Zerschneiden der DNA
2. Reinigung der DNA
3. Doppelhelix wird aufgespalten, wodurch zwei Einzelsträngt entstehen; ein Einzelstrang wird radioaktiv markiert)
4. Der markierte Einzelstrang wird mit einem Einzelstrang einer anderen Art zusammengefügt. Diese schließen sich je nach Komplementarität zur Doppelhelix zusammen
5. Der entstandene DNA-Strang wird denaturiert
→ Je näher verwandt, desto mehr Wasserstoffbrücken sind entstanden; Den Verwandtschaftsgrad kann man durch den Vergleich der benötigten Energie zur Spaltung der Wasserstoffbrücken erkennen (Je mehr Energieaufwand, desto näher die Verwandtschaft)